Microsoft Internet Security and Acceleration (ISA) Serwer 2004 uzyskał certyfikat Common Criteria poziomu 4+ EAL (Evaluation Assurance Level). Stopień 4 jest najwyższym z możliwych do uzyskania, jednocześnie uznawany przez wszystkie państwa uczestniczące w certyfikacji CC. Zapewnia on głęboką analizę i ocenę produktu, a także iż został on gruntownie przetestowany pod względem bezpieczeństwa w różnych warunkach przez niezależne laboratoria.