Pierwszą czynnością którą powinniśmy wykonać po zainstalowaniu programu jest uaktualnienie go. W tym celu po uruchomieniu programu w głównym oknie klikamy Update aby pobrać najnowszą wersję bazy zagrożeń sieciowych. Aktualizację powinniśmy przeprowadzać często (nie zaszkodzi nawet przed każdym uruchomieniem skanowania). Domyślne ustawienia programu zazwyczaj wystarczają do codziennej pracy, jednak warto znać możliwości programu. Aby przejść do okna ustawień klikamy opcję Settings. Zmiany możemy wprowadzać w pięciu różnych zakładkach:
- Browsers - ustawiamy tu domyślną stronę startową naszej przeglądarki oraz stronę wyszukiwania.

- Scanning - znajdują się tu opcje skanowania, przyspieszenia pracy oraz czyszczenia. Wybieramy tutaj zagrożenia, którymi program powinien się zająć oraz sposób w jaki ma to zrobić. Ciekawymi funkcjami są skanowanie w tle, czy też opuszczanie przy skanowaniu plików większych od zadanej wartości.

- Auto Scans - funkcje rozpoczęcia różnych typów skanowania natychmiast po starcie systemu lub programu, jak również pobierania definicji bezpośrednio przed skanowaniem. Na uwagę zasługują przede wszystkim opcje w bloku Safety, gdzie decydujemy o aktualizacji programu przy starcie.

- UI - tutaj dostosowujemy interfejs użytkownika do swoich potrzeb. Mamy wpływ między innymi na dźwięk odgrywany podczas znalezienia infekcji, wybór skórki programu (jeśli domyślny nie spełnia oczekiwań) a także języka używanego przez aplikację.

- Log Files - ustawianie ścieżki dostępu i sposobu logowania wykonanych przez program czynności, a także dokładny wybór danych, które mają się w logu zawrzeć.

Wszelkie wprowadzone modyfikacje zapisujemy używając przycisku Save a wprowadzone zmiany cofamy klikając Reset Settings. Najbardziej znaczącą niedogodnością wynikającą z używania wersji Ad-aware FREE jest brak ochrony przed zagrożeniami w czasie rzeczywistym, jednak gdy będziemy mądrze i w miarę często korzystać z dobrodziejstw tego produktu jesteśmy w stanie ustrzec się przed większością zagrożeń sieciowych bez konieczności zakupu rozszerzonej wersji.