Wraz ze startem systemu uruchamiane są również inne aplikacje. Program Windows Defender monitoruje je, dopuszcza bądź blokuje. Pełną listę znajdziemy w Eksploratorze Oprogramowania. W głównym menu wybieramy Narzędzia. W kolejnym module, w sekcji o tej samej nazwie klikamy Eksplorator oprogramowania. Z rozwijanego menu Kategoria wybieramy Programy grupy Autostart. Po chwili widzimy pełny wykaz aplikacji uruchamianych przy starcie Windows zarówno dozwolonych, jak i zablokowanych.

Jeśli spis jest długi możemy pogrupować pozycje według dwóch kategorii:

• Typ uruchomienia – miejsce, w którym program został umieszczony np. rejestr
• Wydawca – producent aplikacji.

Aby tego dokonać należy kliknąć prawym przyciskiem myszy, a następnie z menu wybrać jeden z powyższych typów, bądź usunąć podział zaznaczając Bez grupowania. Jeżeli jesteśmy lokalnym administratorem możemy również wyświetlić programy startowe wszystkich użytkowników tego komputera klikając Pokaż dla wszystkich użytkowników.

Aplikacje, które uznamy za niebezpieczne możemy wyłączyć lub usunąć. Program dezaktywowany cały czas będzie się znajdował na liście, więc bez problemu ponownie go aktywujemy, gdy uznamy za bezpieczny. Usunięcie spowoduje trwałe zablokowanie i wymazanie z Programy grupy Autostart. Kontrolki Włącz, Wyłącz, Usuń znajdują się u dołu okna. W prawej części wyświetlane są szczegółowe informacje, m.in. Nazwa, Opis, Wydawca, Lokalizacja, Klasyfikacja. Dzięki nim łatwiej dokonamy analizy uruchamianego programu.