Proces skanowania komputera przez Windows Defender możemy zautomatyzować tworząc harmonogram, dzięki czemu korzystanie z komputera stanie się bezpieczniejsze. W głównym oknie aplikacji klikamy kontrolkę znajdującą się obok ikony koła zębatego opatrzonego napisem Narzędzia. Następnie w sekcji Ustawienia wybieramy Opcje. W nowym oknie najbardziej interesuje nas pierwsza jego część, czyli Skanowanie automatyczne.

Zaznaczamy pole przy Automatycznie skanuj mój komputer (zalecane) i wśród rozwijanych menu wybieramy preferowaną Częstotliwość, Przybliżoną godzinę, oraz Typ. Jeżeli proces skanowania ma być w pełni zautomatyzowany możemy nakazać programowi zastosować się do tzw. Akcji domyślnych. Są to działania dostosowane przez użytkownika do alertów np. wykrycia programu szpiegującego. Wybieramy Zastosuj domyślne działania do elementów wykrytych podczas skanowania, następne ustalamy akcje. Wszystkie dokonane zmiany zatwierdzamy kontrolką Zapisz.